Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl13aP19253 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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