Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Vpreb1P13372 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms