Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa1P11477 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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