Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PolP10400 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PolP10400 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PolP10400 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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