Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms