Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Becn2P0DM65 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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