Protein–RNA interactions for Protein: P06334

T-cell receptor gamma chain C region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06334 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06334 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06334 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06334 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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