Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms