Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01734 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01734 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01734 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01734 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01734 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01734 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01734 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01734 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01734 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01734 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01734 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01734 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01734 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01734 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01734 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01734 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms