Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Ccl20O89093 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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