Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

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Length 1,416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BlmO88700 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BlmO88700 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BlmO88700 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BlmO88700 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BlmO88700 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BlmO88700 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BlmO88700 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BlmO88700 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BlmO88700 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BlmO88700 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BlmO88700 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BlmO88700 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BlmO88700 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BlmO88700 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BlmO88700 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BlmO88700 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BlmO88700 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BlmO88700 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BlmO88700 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BlmO88700 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BlmO88700 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BlmO88700 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BlmO88700 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BlmO88700 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BlmO88700 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BlmO88700 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BlmO88700 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BlmO88700 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BlmO88700 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BlmO88700 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BlmO88700 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BlmO88700 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BlmO88700 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BlmO88700 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BlmO88700 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BlmO88700 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BlmO88700 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BlmO88700 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BlmO88700 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BlmO88700 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BlmO88700 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BlmO88700 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BlmO88700 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BlmO88700 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BlmO88700 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BlmO88700 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BlmO88700 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms