Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Stra6O70491 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stra6O70491 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stra6O70491 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stra6O70491 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms