Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn20O55082 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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