Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SlkO54988 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SlkO54988 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlkO54988 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlkO54988 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlkO54988 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlkO54988 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlkO54988 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlkO54988 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlkO54988 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlkO54988 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlkO54988 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlkO54988 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SlkO54988 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlkO54988 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlkO54988 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlkO54988 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlkO54988 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlkO54988 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlkO54988 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlkO54988 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlkO54988 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlkO54988 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlkO54988 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlkO54988 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlkO54988 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlkO54988 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlkO54988 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlkO54988 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlkO54988 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlkO54988 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlkO54988 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlkO54988 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms