Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cldn5O54942 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cldn5O54942 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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