Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

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Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Timm44O35857 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Timm44O35857 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Timm44O35857 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Timm44O35857 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Timm44O35857 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Timm44O35857 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timm44O35857 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timm44O35857 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms