Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Stag2O35638 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms