Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Clk2O35491 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk2O35491 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk2O35491 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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