Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccrl2O35457 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccrl2O35457 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccrl2O35457 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccrl2O35457 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms