Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna6O35345 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms