Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sh2d1bO35324 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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