Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Casq1O09165 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Casq1O09165 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Casq1O09165 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Casq1O09165 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casq1O09165 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms