Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap23O09044 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap23O09044 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snap23O09044 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms