Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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