Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EllO08856 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EllO08856 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EllO08856 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EllO08856 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EllO08856 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
EllO08856 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
EllO08856 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
EllO08856 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
EllO08856 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EllO08856 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms