Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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