Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms