Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gm3239L7N2D9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gm3239L7N2D9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gm3239L7N2D9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm3239L7N2D9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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