Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gm3278L7N2D2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gm3278L7N2D2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gm3278L7N2D2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gm3278L7N2D2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gm3278L7N2D2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gm3278L7N2D2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Gm3278L7N2D2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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