Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm20878L7N244 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm20878L7N244 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm20878L7N244 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm20878L7N244 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm20878L7N244 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm20878L7N244 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm20878L7N244 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm20878L7N244 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm20878L7N244 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm20878L7N244 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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