Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm2888K7N746 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm2888K7N746 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm2888K7N746 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm2888K7N746 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm2888K7N746 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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