Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm379J3QQ19 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm379J3QQ19 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm379J3QQ19 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm379J3QQ19 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm379J3QQ19 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gm379J3QQ19 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gm379J3QQ19 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Gm379J3QQ19 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Gm379J3QQ19 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm379J3QQ19 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm379J3QQ19 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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