Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gm2056J3QQ02 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gm2056J3QQ02 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gm2056J3QQ02 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gm2056J3QQ02 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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