Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Gm17577J3QNF7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Gm17577J3QNF7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Gm17577J3QNF7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Gm17577J3QNF7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Gm17577J3QNF7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Gm17577J3QNF7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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