Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc180J3QNE4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms