Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm21818J3KMS6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm21818J3KMS6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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