Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms