Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4aF8VPX6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms