Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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