Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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