Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Igkv1-99F6XWB2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms