Protein–RNA interactions for Protein: F6WY25

Gm10271, Predicted gene 10271, mousemouse

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Length 52 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10271F6WY25 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10271F6WY25 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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