Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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