Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms