Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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