Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
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