Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms