Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ryr1E9PZQ0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms