Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcom1E9PZ54 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms