Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms